Chùa hiện tọa lạc tại số 03 Lê Quý Đôn, phường Phú Hội, thành phố Huế, trên diện tích 2000m2; do Thượng tọa Tuệ Tâm làm trụ trì.

Nguyên trước đây, vào năm 1967, Đại đức Giới Hỷ, thay mặt cố Trưởng lão Hòa thượng Giới Nghiêm, Tăng thống Giáo hội Tăng-già Nguyên Thuỷ Việt Nam, đã vận động ông bà Nguyễn Thiện Đông - Nguyễn Thị Cúc cùng quý Phật tử cúng dường tịnh tài mua lại công thổ của chính quyền đương thời một khu dất rộng 9.176 m2 để thành lập chùa. Kế hoạch còn dự kiến xây dựng một ngôi bảo tháp Xá-lợi và trường trung cấp Phạn ngữ; nhưng do hoàn cảnh chiến tranh lúc bấy giờ nên không thể thực hiện được. Tháng 6 năm 1974 chùa có làm lễ đặt đá và xây tạm căn nhà cấp 4 để thờ Phật và làm chỗ cư ngụ cho chư Tăng.

Sau năm 1975, do chính sách đất đai có nhiều biến động, chùa bị lấn chiếm một phần và cũng do kế hoạch mở mang, phát triển của thành phố nên diện tích của chùa bị thu hẹp lại chỉ còn 2000m2. Để thu hồi và duy trì được 2000m2 nầy, Hoà thượng Hộ Nhẫn và chư Tăng Nam Tông Thừa Thiên Huế đã phải mất 10 năm gởi đơn thư khiếu kiện khắp nơi mới đòi lại được quyền quản lý.

Vào năm 2000, Hoà thượng Hộ Nhẫn có văn thư giới thiệu Thượng tọa Tuệ Tâm về trú trì chùa Pháp Luân. Và Giáo hội tỉnh Thừa Thiên Huế có văn thư bổ nhiệm Thượng tọa về làm trú trì ngôi Tam Bảo này.

Năm 2005, sau khi được chính quyền địa phương trả lại đất chùa (2000m2), được sự đồng thuận của Hoà thượng Hộ Nhẫn, lúc ngài còn sinh tiền, và chư Tăng trong Hệ phái Nam Tông, nhất là được sự hỗ trợ tinh thần lẫn vật chất của Hòa thượng Pháp Nhẫn, Sư cô Trí Hạnh và Phật tử chùa Liên Hoa - Hoa Kỳ; Hoà thượng Viên Minh, Thượng tọa Tịnh Đức, Thượng tọa Khánh Hỷ, Thượng tọa Bửu Đức và chư Tăng Ni, Phật tử trong và ngoài nước, một cơ sở khám chữa bệnh từ thiện đã được xây dựng khang trang trên diện tích gần 600m2. Cơ sở nầy được lấy tên là Tuệ Tĩnh Đường Liên Hoa. Hằng ngày nơi đây đã tiếp đón và điều trị bằng phương pháp Đông y cho khoảng 200 bệnh nhân. Ngoài ra, hằng tháng còn tổ chức những chuyến đi khám chữa bệnh, châm cứu và cấp phát thuốc miễn phí cho bệnh nhân nghèo ở vùng sâu vùng xa, mỗi chuyến đi 10 ngày. Hiện Thượng tọa Tuệ Tâm, lương y đa khoa cấp quốc gia là giám đốc điều hành cơ sở nầy.

Riêng ngôi chánh điện thờ Phật, do chưa đầy đủ nhân duyên nên đến nay vẫn chưa có kinh phí để xây dựng. Chư Tăng Hệ phái Nam Tông Thừa Thiên Huế và Thượng tọa Tuệ Tâm đang vận động quyên góp từ các Phật tử tín tâm, các nhà hảo tâm để hoàn thành ngôi chánh điện hầu có nơi chốn cho Phật tử lui tới lễ bái cúng dường và chư Tăng cũng có chỗ an trú tu học.

Một vài hình ảnh khám chữa bệnh tại Tuệ Tĩnh Đường Liên Hoa: